بیمارستان شهید دکتر رهنمون
بیمارستان شهید دکتر رهنمون (فرخی قدیم) که از قدیمی ترین بیمارستان های استان یزد می باشد؛ در سال ۱۳۱۴به صورت یک بهداری تاسیس شد. با گذشت زمان و پیشرفت علم و دانش و نیاز روزافزون به مرکز درمانی پیشرفته تر این بهداری به صورت یک بیمارستان در سال ۱۳۲۱ تاسیس و در سال ۱۳۲۶ به بهره داری رسید. پس از پیروزی انقلاب اسلامی به یاد فرخی یزدی (شاعر ،روزنامه نگارو سیاستمدار دوران پهلوی) به نام بیمارستان فرخی نامگذاری گردید.
در سال ۱۳۵۸ اولین بخش اطفال در استان توسط دکتر برخورداری و یک پزشک هندی در این بیمارستان دایر گردید. در سال ۱۳۶۳ به یاد شهید دکتر رهنمون (مسئول بیمارستان صحرایی که درسال ۱۳۶۲ در سن ۲۶ سالگی در عملیات خیبر در بیمارستان صحرایی خاتم الانبیاء منطقه طلاییه در حال اقامه ی نماز صبح و به دنبال بمباران شدن بیمارستان توسط هواپیماهای ارتش بعث عراق به شهادت رسید). در سال ۱۳۶۶ اورژانس بیمارستان توسط حاج بمانعلی کلانتری ساخته و به این مجموعه اضافه گردید.

بیمارستان شهید صدوقی یزد
این مجتمع بزرگترین مرکز آموزشی درمانی جنوب شرق کشور مزین به نام سومین شهید محراب آیت الله صدوقی (ره) است که شامل :
بیمارستان شهید صدوقی :
این ساختمان در سال ۱۳۸۰ به بهره برداری رسید شامل :
زیر زمین : بخش عفونی – آشپزخانه بیمارستان
طبقه همکف : بخش داخلی یک – بخش داخلی دو – آزمایشگاه – پاتولوژی – آندوسکوپی و کلونوسکوپی – اداری – اورژانس بزرگسال– پاتولوژی – فیزیوتراپی – آزمایشگاه – مهد کودک – پاویون – فروشگاه (بوفه ) – بانک .
·طبقه اول : جراحی – بخش مراقبت های ویژه (ICU ) – بخش گوش و حلق و بینی – اتاق عمل جنرال – آنژیو گرافی
·طبقه دوم : قلب – سی سی یو – بخش پیوند – اتاق عمل و مراقبت ویژه پیوند – اتاق اکو
·طبقه سوم : مغز و اعصاب – چشم – ارتوپد
.بیمارستان کودکان شهید مسعودی :
شامل اورژانس اطفال ، بستری اطفال ، بخش مراقبت ویژه نوزادان (NICU) ، PICU
.بیمارستان جامع زنان کوثر :
·طبقه همکف : اتاق عمل زنان – صدور گواهی ولادت – تریاژ زنان – واحد بهداشت – کنترل عفونت
·طبقه اول : مراقبت ویژه ثامن ، بارداری پر خطر
·طبقه دوم : اتاق زایمان
·طبقه سوم : بخش زنان
.بیمارستان خون و انکولوژی
طبقه همکف : درمانگاه خون و تالاسمی
طبقه اول : انکولوژِی بزرگسال
طبقه دوم : انکولوژی کودکان
طبقه سوم : جراحی و مراقبت ویژه انکولوژی
طبقه چهارم : مرکز تحقیقات خون و سرطان
مجتمع درمانی دیالیز و پیوند( در حال ساخت)
مجتمع طب سنتی (در حال ساخت )
.مجتمع آموزشی – درمانی – پژوهشی ناباروری ( در حال ساخت )

بیمارستان شهدای محراب
پس از راه اندازی دانشگاه علوم پزشکی در راستای خدمت رسانی به بیماران دچار سوختگی در سال ۱۳۵۹ ، پروژه ساخت بیمارستان سوانح سوختگی شروع و در سال ۱۳۶۱ با بخش های سوختگی ، درمانگاه سرپایی و اتاق عمل راه اندازی شد و با گسترش بیمارستان بخش های پوست و ترمیمی ، اورژانس ، جراحی زیبایی به آن اضافه گردید . با شروع طرح تحول سلامت در سال ۱۳۹۳و در راستای اهداف طرح تحول، ارتقای فضای فیزیکی و هتلینگ بیمارستان در دستور کار قرار گرفت و کلینیک تخصصی و فوق تخصصی راه اندازی شد . در حال حاضر به منظور افزایش تعداد تخت های بیمارستانی پروژه ساخت ساختمان جدید بیمارستان مشتمل بر بخش های سوختگی ، BICU ، اتاق عمل و اورژانس در مرحله اجرا می باشد .
هم اکنون این بیمارستان پذیرای مراجعین نیازمند درمان در زمینه سوختگی ، جراحی های عمومی ، جراحی عروق ، ترمیمی و زیبایی ، بیماریهای داخلی ، پوست و زیبایی است .

بیمارستان افشار
بیمارستان افشار در ۳ طبقه با مساحت ۲۲۰۰۰مترمربع و زیر بنای ۱۵۷۰۰ متر مربع درشمال غربی استان یزد در سال ۱۳۵۶ به همت مرحوم آقای محمدصادق افشار به بهره برداری رسید و در حال حاضر یکی از مراکز درمانی دولتی استان به حساب می آید . این مرکز با ۲ بخش داخلی قلب، ۶ بخشCCU، ۲بخش ICU قلب، بخشهای جراحی قلب، جراحی زنان و مردان، اتاق عمل قلب، اتاق عمل جنرال، اتاق زایمان، آنژیوگرافی، الکتروفیزیولوژی، NICU ، اورژانس و اورژانس قلب با ۱۷۷ تخت فعال و ۲۳ تخت اکسترا- ستاره دار و تجهیزات کامل می تواند به بیماران عزیز ارائه خدمت نماید .
این بیمارستان با داشتن بخشهای پاراکلینیک از قبیل آزمایشگاه ، رادیولوژی، سونوگرافی، اکو و تست ورزش ، اسکن هسته ای ، هولتر ، CT آنژیوگرافی می تواند به صورت سرپائی به تمامی همشهریان عزیز چه در داخل استان وچه درخارج استان خدمت رسانی کند.
این مرکز با انجام خدمات تخصصی و فوق تخصصی توسط پزشکان و اساتید مجرب و متعهد درزمینه جراحی قلب ، داخلی قلب ، آنژیوگرافی، آنژیو پلاستی بعنوان تنها مرکزدولتی قلب استان بوده که با انجام تعداد متوسط ۸۰-۷۵ عمل قلب و ۳۵۰ آنژیوگرافی و ۲۰۰ آنژیوپلاستی ماهیانه یکی ازمهم ترین مراکز قلب جنوب کشور می باشد.
اجرای برنامه مدیریت درمان سکته حاد قلبی (۲۴۷) ، از جمله فعالیت های مهم این مرکز می باشد که با وجود پزشکان و پرسنل مجرب ، بیماران STE MI تحت آنژیوپلاستی قرار گرفته و با این روش میزان مرگ و میر این بیماران از ۱۱ درصد به ۴ درصد کاهش یافته است.
این مرکز با توجه به فعالیت تیم بازتوانی درون بخشی، کلینیک پیگیری و پیشگیری و توانبخشی قلبی اقدام به عضویت در شبکه جهانی HPH[۱] نموده است و در راستای ارتقاء سلامت در حیطه های بیمار ، همراهان، محیط و جامعه گام های موثری را برداشته است.
بیمارستان افشار با فعالیت بیش از دهها عضو هیئت علمی در زمینه آموزش به دانشجویان پزشکی، تخصصی قلب و همچنین رشته های بهداشتی ودرمانی به عنوان مرکز آموزشی درمانی به حساب می آید. همچنین این مرکز درمانی، آموزشی و پژوهشی با داشتن مرکز تحقیقات قلب وعروق و با تلاش وپشتکار پزشکان و پرسنل در جهت ارائه طرحهای پژوهشی تحقیقاتی فعالیت می نماید که نتایج آنها در مجلات مهم داخلی و بین المللی به چاپ رسیده است .
در این بیمارستان با انجام هفت عمل پیوند قلب به عنوان یکی از مراکز هماهنگ کننده پیوند اعضاء مشغول به فعالیت بوده که با هماهنگی بین بیمارستانهای استان و سایر مراکز درمانی کشور قادر به ارائه خدمات به بیماران نیازمند اهداء عضو می باشد .
کلینیک تخصصی این مرکز در تمامی زمینه ها از قبیل جراحی قلب ، داخلی قلب ، داخلی ، ارتوپدی ، زنان وزایمان ، غدد، ENT، اطفال، قلب اطفال، عفونی، اعصاب و روان ، ریه ، آسم و آلرژی اطفال ، اکو وتست ورزش ، الکتروکاردیوگرافی ، هولتر مانیتورینگ و سونوگرافی یکی از فعالترین کلینیک های تخصصی این استان می باشد.
این بیمارستان با گذشت ۴ دهه علیرغم خدمات فراوانی که در عرصه درمان شهرستان یزد ارائه نموده ، ساختار فیزیکی و تاسیسات آن مستهلک و فرسوده گردیده است . تیم مدیریت بیمارستان برخود لازم دانسته تا جهت بالا بردن کیفیت خدمات ارائه شده در جهت اصلاح و بهسازی ساختار فیزیکی ، تاسیساتی و گردش کار بیمارستان گام های اساسی بردارد. لذا تحولات اساسی در این زمینه شامل بازسازی کامل اتاق عمل قلب، اتاق زایمان، اورژانس، بخش بستری قلب، سی سی یو ها، بخشCT آنژیوگرافی و … بوده است.
همچنین احداث پروژه کلینیک تخصصی و فوق تخصصی با کمک خیری و دانشگاه نیز از دیگر اقدامات نوسازی بیمارستان می باشد.
لازم به ذکر است بیمارستان افشار در فرآیند ارزیابی استانداردهای اعتبار بخشی که از طریق وزارت بهداشت و درمان و آموزش پزشکی سالانه در راستای استانداردسازی بیمارستان ها در زمینه بهبود کیفیت خدمات و ایمنی بیماران انجام می پذیرد موفق به کسب رتبه درجه یک گردیده است.

مرکز جامع روانپزشکی یزد
به همت و همراهی آیت الله حاج ابوالقاسم وافی و کمک های خیر محترم زنده یاد آقای حاج محمد حسین سپهر در سال ۱۳۶۵ کلنگ احداث مرکز جامع روانپزشکی واقع در شهرستان تفت توسط مرحوم حضرت آیت الله خاتمی به زمین زده شد و در طی دو سال با پیگیری های هیات امنای محترم و تلاش های آقای سید فضل الله کلانتری، ساختمان بیمارستان در سال ۱۳۶۷ آماده بهره برداری شد و در زمان ریاست وقت بیمارستان آقای دکتر صبا به بهره برداری رسید و فعالیت آموزشی و درمانی خود را شروع کرد. این مرکز در حال حاضر یک بیمارستان آموزشی، درمانی، پژوهشی می باشد. که دارای تعداد۱۰ نفر هیئت علمی و تعداد ۱۷ نفر دستیار روانپزشکی می باشد.
